Deskripsi
DNA barcode sebagai ide ilmiah yang telah menarik perhatian dunia sebagai sistem terbaru dalam identifikasi hampir semua spesies fauna, baik interspesifikasi maupun intraspespesifik secara cepat dan akurat. Penanda gen Cytochrome c Oxidase subunit I (COI) dari genom mitokondria DNA (mtDNA) yang merupakan sekuen DNA untuk digunakan sebagai DNA barcode. Sistem ini terinspirasi oleh “barcode”, tag hitam dan putih pada identifikasi produk di supermarket. Sebuah tag jaringan fauna dapat digunakan untuk mengungkapkan kode genetik DNA yang unik di Laboratorium. DNA barcode juga menjadi salah satu alternatif pengganti dari identifikasi taksonomi klasik yang kurang praktis. DNA barcode juga menjanjikan beberapa manfaat, antara lain mengenai spesies, memastikan keamanan pangan memastikan keberadaan spesies larva, mengontrol hama pertanian, dan melacak asal usul vektor penyakit dan serangan hama pada suatu area. Tujuan penulisan buku ini untuk menyebarkan informasi perkembangan paling mutakhir dalam penerapan teknik molekuler untuk karakterisasi fauna. Teknik DNA barcode telah terbukti mampu menjembatani ketidakseimbangan antara jumlah spesies yang masih belum diketahui namanya dengan jumlah taksonomiwan/wati yang jumlahnya sangat sedikit di Indonesia.
Daftar Isi
BAB 1 DNA BARCODE………………………………………………………. 9
Hari Sutrisno, M. Syamsul Arifin Zein, Sri Sulandari
A. Sejarah DNA Barcode………………………………………………….. 10
B. Mengapa DNA Barcode Diperlukan……………………………….. 13
C. Strategi Pengembangan DNA Barcode Fauna………………….. 15
D. Gen COI Barcode Region………………………………………………. 16
E. Non-COI Barcode Region……………………………………………… 17
Daftar Pustaka…………………………………………………………………. 21
BAB 2 TAHAPAN KERJA DALAM DNA BARCODE……………..23
Sri Sulandari, Moch. Syamsul Arifin Zein, Hari Sutrisno, Anik Budhi Dharmayanthi, Inda Natalia
A. Teknik Pengambilan dan Pengawetan Material DNA………… 25
B. Pengiriman Spesimen atau Sampel dari Lapangan
ke Laboratorium………………………………………………………… 47
C. Ekstraksi DNA…………………………………………………………… 49
D. Pemilihan Primer……………………………………………………….. 58
E. PCR (Polymerase Chain Reaction)………………………………….. 80
F. Sekuen Fragmen DNA……………………………………………….. 104
Daftar Pustaka……………………………………………………………….. 120
BAB 3 PENGELOLAAN KOLEKSI SPESIMEN ACUAN………129
Mohammad Irham dan Yuli Sulistya Fitriana
A. Mengapa Darah Tidak Cukup……………………………………… 131
B. Pengelolaan Spesimen………………………………………………. 135
C. Data Spesimen Acuan……………………………………………….. 137
D. Penyimpanan dan Penataan Spesimen Acuan……………….. 142
Daftar Pustaka……………………………………………………………….. 145
BAB 4 PERANAN DNA BARCODE UNTUK KEHIDUPAN….149
Dewi Malia Prawiradilaga, Tri Haryoko, Mohammad Irham, Sri Sulandari, M. Syamsul Arifin Zein, Yuli Sulistya Fitriana, Anik Budhi Dharmayanthi, Evy Ayu Arida
A. Pertimbangan Penggunaan DNA Barcode……………………… 150
B. Peranan DNA Barcode……………………………………………….. 153
C. Studi Kasus Penggunaan DNA Barcode…………………………. 160
Daftar Pustaka……………………………………………………………….. 187
BAB 5 PERKEMBANGAN DNA BARCODE DI INDONESIA.197
M. Syamsul Arifin Zein, Sri Sulandari, Hari Sutrisno, Dewi Malia Prawiradilaga, M. Irham, Tri Haryoko
A. Bank DNA Fauna Indonesia……………………………………….. 199
B. Peran Pusat Penelitian Biologi-LIPI dalam Pengembangan DNA Barcode…………………………….. 206
C. Strategi Pengembangan…………………………………………….. 207
D. Hasil yang Dicapai……………………………………………………. 215
Daftar Pustaka……………………………………………………………….. 218
DAFTAR ISTILAH…………………………………………………………..221
INDEKS………………………………………………………………………….231
PENYUNTING & KONTRIBUTOR……………………………………237
Ulasan
Belum ada ulasan.